Tras el paso de los huracanes Irma y María en septiembre de 2017 en Puerto Rico, alcaldes y alcaldesas de los 78 municipios se movilizaron para restablecer servicios esenciales y coordinar ayuda directa a las comunidades afectadas. Reconociendo el papel crucial de los alcaldes en proveer respuesta inmediata, el exalcalde de Nueva Orleans, Mitch Landrieu, y Open Society Foundations lanzaron el Intercambio de Alcaldes en febrero de 2018. Durante este programa, se realizaron 24 visitas a los 27 alcaldes que participaron y se proveyó un taller de asistencia técnica al que asistieron 17 municipios y más de 40 expertos en recuperación de desastres, desarrollo, planificación y gestión fiscal.

Los objetivos eran proporcionar asistencia directa a los alcaldes para abordar desafíos fiscales y de reconstrucción, además de crear defensores en Estados Unidos para apoyar la recuperación de Puerto Rico.

En junio de 2018, un grupo de alcaldes y alcaldesas de Puerto Rico que había participado en el programa de Intercambio formó un grupo de trabajo para crear una coalición no partidista de municipios, centrada en la colaboración intermunicipal a largo plazo y el diálogo con líderes en Puerto Rico y EU. La coalición recibió asistencia técnica, y en noviembre de 2018, celebraron el Primer Conversatorio de Alcaldes y Alcaldesas. Tras obtener el respaldo de la Fundación Ford, junto con Open Society Foundations, lanzaron formalmente la Liga de Ciudades de Puerto Rico el 4 de octubre de 2019, consolidando su esfuerzo por construir una organización formal para el beneficio continuo de las comunidades locales.